История начинается на Земле. Джейк Сэлли (Сэм Уортингтон) — солдат, незнающий, во имя чего ему сражаться. Ранение спровоцировало инсульт, в результате чего у Джейка отнялись ноги. Поэтому едва ему подворачивается возможность убраться с планеты и отправиться к далекой Пандоре чтобы работать на горнодобывающую промышленность, он не раздумывая соглашается.
Пандора — маленькая луна, вращающаяся вокруг газообразного гиганта — является единственным во вселенной месторождением редчайшего элемента, способного революционизировать процесс получения энергии. Пандора богатая, но трудно осваиваемая планета: ее воздух ядовит, растения и животные хищны и очень опасны. А местные обитатели, голубокожие трехметровые гуманоиды, называющие себя На’ви, совсем не рады человечеству, вторгшемуся на Пандору и уродующему планету в поисках вожделенного элемента.
Из-за опасностей, подстерегающих добытчиков на Пандоре, обычные меры предосторожности в виде брони и скафандров недейственны. Для защиты шахтеров была разработана специальная программа, объединившая ДНК людей и На’ви. Продуктом такой операции является клон На’ви с разумом и сознанием носителя человеческого ДНК — аватар (олицетворение). Первоначальным донором одного из таких аватаров был убитый брат Джейка Сэлли. А так как стоимость аватара невероятно высока, корпорация попросила носителя идентичного ДНК занять место погибшего. Для Джейка это означает вновь обрести возможности ходить.
История перемещается на несколько лет вперед, к моменту прибытия Сэлли на Пандору. Он видит планету необычайной красоты, где леса буйны красками и разнообразием видов, флора и фауна люминисцирует по ночам, создавая ощущение сказочного сада чудес, а горные вершины возвышаются над тридцатиметровыми деревьями. Работая на корпорацию, Джейк сталкивается с Вайпервульфом (волком-гадюкой), одной из многочисленных опасностей, подстерегающих здесь людей. Но прежде, чем хищник успевает наброситься на него, животное погибает от стрелы , выпущенной лучницей На’ви (Соэ Сальданья). С ней Джейк начинает постигать настоящий мир Пандоры.
На’ви живут в идеалистической гармонии с хищным миров планеты. Глазами своей спасительницы Джейк начинает по-новому смотреть на вторгшихся сюда людей. Он понимает, что наконец-то обрел смысл в жизни, нашел цель, ради которой стоит бороться. Но присоединение к армии На’ви, сражающейся против человеческих инвайдеров, может даться ему дорогой ценой: он не сможет оставаться в своем аватаре вечно. Когда аватар засыпает, Джейк возвращается в свое бренное тело. С помощью технического интерфейса ему необходимо слить свои сознание и олицетворение воедино — если он примет сторону На’ви в войне против людей, он потеряет возможность быть аватаром, в противном случае он останется заключенным в парализованном теле без той На’ви, которую полюбил.
